幕末的传奇刽子手绯村剑心，在新时代立下不杀之誓，用逆刃刀保护身边的人们。
不死的新人类“亚人”被政府视为研究对象，普通高中生永井圭发现自己竟是亚人后，展开逃亡。
人体自燃现象频发，特殊消防队与焰人战斗，同时揭露背后的巨大阴谋。